常見的厭氧反應器有UASB厭氧反應器，IC厭氧反應器，EGSB厭氧反應器。其中UASB反應器、厭氧流化床、厭氧生物轉盤和擋板式厭氧反應器屬于第二代厭氧反應器，他們的主要特點有：停留時間短，有機負荷高，處理效率高；HRT和SRT分離，SRT相對很長，HRT則可以較短，反應器內生物量很高。以上這些特點改變了原來人們對厭氧生物過程的認識，因此在污水處理中應用越來越廣泛。
進人20世紀90年代以后，隨著以顆粒污泥為主要特點的 UASB 反應器的廣泛應用，在其從礎上又發展起來了同樣以顆粒污泥為根本的顆粒污泥膨脹床（ EGSB ）反應器和厭氧內循環（IC）反應器。其中 EGSB 反應器利利用外加的出水循環可以使反應器內部形成很高的上升流速，提高反應器內的物質與微生物之間的接觸和反應，可以在較低溫度下處理較低濃度的有機污水，如城市污水等；而 IC 反應器則主要應用于處理高濃度有機污水，依靠厭氧生物過程本身所產生的大量沼氣形成內部混合液的充分循環與混合，可以達到更高的有機負荷。這些反應器又被統一稱為“第三代厭氧生物反應器”